De nombreux coronavirus touchent les espèces animales. Ils ont généralement un tropisme digestif et/ou respiratoire mais ne sont pas pathogènes pour l'homme.

Le SARS-CoV2 est un Betacoronavirus, appartenant au sous-genre Sarbecovirus

Les coronavirus suivants n'ont aucune relation avec le SARS-CoV2 responsable du Covid19 humain

• tout d'abord les coronavirus identifiés chez nos animaux domestiques, qui n'ont aucun rôle zoonotique, donc pas de transmission à l'homme. Ils ne présentent aucun danger pour l'homme
  • Alphacoronavirus: coronavirus entérique/virus de la péritonite infectieuse féline du chat ; coronavirus entérique/pantropique du chien, virus de la gastro-entérite du porcelet, virus de la diarrhée épidémique porcine
  • Betacoronavirus
    • Embecovirus : le coronavirus entérique bovin, le coronavirus entérique équin, le coronavirus hémagglutinant de l'encéphalomyélite porcine (porcine hemagglutinating encephalomyelitis virus, responsable de la vomiting and wasting disease) et le coronavirus respiratoire canin
  • Gammacoronavirus: virus de la bronchite infectieuse aviaire
  • Deltacoronavirus: deltacoronavirus porcin.
• Ensuite chez l'homme : quatre virus impliqués dans le rhume (signes respiratoires supérieurs)
  • Alphacoronavirus: HCoV 229E et HCoV NL63
  • Betacoronavirus: HCoV OC43 et HCoV HKU1
  • Aucun de ces virus humains ne présente de parenté avec le SARS-CoV2. 

• Les Coronavirus, biologie cellulaire et moléculaire. Laude. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2003, 156-3, 17-30 

• Sun, Trends Molecular Medicine, 2020: COVID-19: Epidemiology, Evolution, and Cross-Disciplinary Perspectives
  • Similarities of receptor sequence binding to 2019-nCoV between humans and animals suggest a low species barrier for transmission of the virus to farm animals.
• Histoire des coronavirus animaux (COVID-19 from veterinary medicine and one health perspectives: What animal coronaviruses have taught us, Decaro et al., Res. Vet Science, 2020) 

Coronavirus Aviaire

Coronavirus Bovin

• Mise en édidence d'un agent de type coronavirus dans les fécès de bovins atteints d'entérite hémorragique d'hivers (winter dysentery). Espinasse J., L'Haridon R., Viso M., Savey M., Laval A., Ke Layec C., Blot J.P., Cohen J. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France. 1981

  Les Coronaviroses des Bovins, Note de Bertrand Redrimont

   

Coronavirus chez les Furets

•  Coronavirus chez les furets (Dr-Vét. Boussarie-Membre de l'AVF)

Coronavirus Canin

• Coronavirose entérique du chien (CCoV) 

Coronavirus chez les Chauves souris

• Lattine et al. Origin and cross-species transmission of bat coronaviruses in China

Une étude portant sur les coronavirus hébergés chez les chéiroptères du sud et sud-ouest de la Chine établi 630 séquences génomiques partielles (440 nt dans la région RdRp, la plus conservée du génome), doublant ainsi le nombre de séquences disponibles. Les reconstructions phylogénétiques réalisées sur 701 séquences d'a-coronavirus issues de 41 espèces de chauves-souris, et 528 séquences de ß-coronavirus issues de 31 espèces, apportent plusieurs informations intéressantes. Rappelons que le virus Sars-CoV2 est un ßCov, et qu'un a-CoV fut responsable de foyers épidémiques de Sads (Swine acute diarrhea syndrom) dans les années récentes*. Des chauves-souris appartenant aux genres Rhinolophidae seraient les hôtes ancestraux majeurs des coronavirus présents en Asie. Les espèces étudiées se distribuent en 16 genres, dont la majorité (10/16) sont infectés à la fois par des a-CoV et des ß-CoV. A l'échelle de l'évolution, les événements de saut d'espèce interfamiliaux peuvent impliquer des taxa éloignés, et apparaissent plus fréquents chez les a-CoV, pour lesquels l'éloignement phylogénétique entre hôtes exercerait donc une contrainte moins forte que pour les ß-CoV. A l'échelon du genre, une fréquence similaire s'observe, avec une vingtaine de sauts d'espèce intra-familiaux prédits. En conclusion, cette étude, la plus exhaustive à ce jour, indique que les coronavirus, et particulièrement les a-CoV, ont une propension au changement d'hôte y compris au sein de leurs réservoirs naturels. (Commentaires de H. Laude (BAVF 2020))

Coronavirus Cunicole

• Les coronavirus du lapin. Ridremont B. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2020

Coronavirus Equin

Coronavirus de la Faune Sauvage

Coronavirus Félin

• La péritonite infectieuse féline (PIF) (Professeur S. Lepoder)

• Coronavirus chez le chat léopard et le Furet (Dong, J Virol, 2007)

Coronavirus murin

• Les souris normales ne sont pas sensibles à Sars-Cov-2 (seules les souris hACE2 développent une maladie)

Coronavirus Ovin et Caprin

• Coronavirus ovin et Caprin (Dr. Ridremont)

Coronavirus Porcin

• Les coronavirus Porcins (Vlasova et al, 2020).

• Le coronavirus respiratoire porcin PRCV: un virus émergent pas comme les autres (Laude, Virologie, 1998)

Coronavirus chez les Primates non-humains

• Covid-19 chez le Macaque cynomolgus

• Vaccins vétérinaires contre les coronaviroses animales dans le contexte Covid-19 - Bref Aperçu. Charley B., Audonnet J-C. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2020. 

Le pangolin

• Le Pangolin - Une revue par le Dr. BOUSSARIE (membre de l'AVF)
• Le Pangolin - Une espèce protégée - Une revue par le Dr. RIGOULET (membre de l'AVF)

Les chauves souris

• Les chauves-souris, source inépuisable de virus dangereux pour les humains ? Leroy E., The conversation

Le chien viverin